Национальный музей является учреждением не только культурным, но также и научной институцией.

В музее работают 37 научных сотрудников, из них 2 доктора наук, 2 кандидата наук. Научная работа сотрудников строится на изучении музейных коллекций, которая выражается в научных публикациях, научных концепциях выставки, научных описаниях предмета и т.д.

В Национальном музее проводятся научные конференции на разные темы, связанные с изучением культуры и истории, а также природы Республики Тыва.